Rond 1990 was er weer een nieuw tijdperk, het computertijdperk. De lokalen bij de
bovenbouw kregen de eerste computers met floppy's. De leerkrachten gingen terug
naar de Pabo om zichzelf wegwijs te laten maken in het werken met computers.
In 2001 zijn beide scholen ingrijpend verbouwd en aan elkaar verbonden, zodat
het nu een groot schoolgebouw is. De oude aula werd verdeeld in een lokaal en een
ruime koffiekamer. De oude koffiekamer werd kantoor voor de directeur en een
ruimte voor remedial teaching. Tussen beide gebouwen kwam een lange gang
met een grote aula (de meester Cees zaal), aan beide kanten een lokaal en aan de
kant van groep 1-2 een nieuw toiletblok, een keukentje en een invalidentoilet.
Het werd een lange school met drie ingangen, drie pleinen met één adres Sperwer 1.
Nog steeds heet een van die pleinen het Meester Jan Scheerplein
Nog vele veranderingen volgden. Er kwam een conciërge, Remedial teaching
veranderde in een interne begeleiding en een onderwijs-assistente, Zwarte
schoolborden werden vervangen door digiborden, die ook bij de kleuters gebruikt
worden.
In 2001 ging directeur Cees Henselmans naar een andere school. Jaren later
zouden we hem weer terugzien als begeleider van de jeugd EHBO en de Plusklas.
Arthur Jansen werd een aantal jaren directeur op de Paus Johannesschool.
Na een periode met interim-directeuren werd Evert Tolhuijs als directeur benoemd.
Sinds 2010 valt de Paus Johannesschool onder de Atrium Stichting
samen met de scholen:
- Sint Maartenschool, Oudkarspel
- Duizend Eilandenschool, Noord-Scharwoude
- Mariaschool, Noord-Scharwoude
- Koolvlet, Broek op Langedijk
- Sint Josephschool. Heerhugowaard-Noord
Na 4 jaar, in 2011, werd Evert Tolhuijs opgevolgd door de huidige directeur Frans
van de Gevel. Op dit moment heeft de school 317 leerlingen verdeeld over 13
groepen waarvan er 2 gehuisvest zijn in het gebouw van de Phoenix (voorheen de
Wielewaal later de Steltloper). Er zijn 21 leerkrachten (waarvan 1 man) 1 directeur,
1 intern begeleider, 1 conciërge, 1 administratief medewerkster, 3 onderwijs-
assistentes, 2 schoonmaaksters, 4 gymdocenten, 1 invalster en 4 vaste oud
leerkrachten die hulp geven aan kinderen, die wat extra hulp nodig hebben en
